港澳通行证出生地不一样，可能可以正常过关，但也可能在办理港澳通行证或出入境时遇到问题。

根据公开发布的信息，出生地与出生证明不一致，并不影响办理港澳通行证。因为办理港澳通行证的申请条件并未要求出生地与出生证明必须一致。只要申请人能提供符合规定的申请材料，即可按照正常流程申请港澳通行证。这些材料通常包括填写完整的申请表、有效居民身份证、户口簿原件等。

然而，在实际操作中，如果存在出生地不一致的情况，有些地方的出入境管理部门可能会要求申请人进行相关的证明或更正。例如，有案例显示，因为户口簿中出生地与出生证明上的出生地信息不一致，出入境管理部门拒绝办理港澳通行证，并要求申请人先更新户口簿中的信息。

因此，虽然理论上出生地不一致不影响办理港澳通行证，但为了避免不必要的麻烦和延误，建议在办理前尽量确保所有证件上的出生地信息一致。如果发现不一致，应及时向当地公安机关或派出所咨询并办理相关更正手续。

总的来说，虽然出生地不一样可能不会直接导致无法过关，但为了确保顺利出入境，最好还是保持证件信息的一致性。