北京中水科工程集团有限公司是国企。

北京中水科工程集团有限公司是中国水利水电科学研究院全资企业，由中国水利水电科学研究院实际控制并持有100%的股权。中国水利水电科学研究院作为国有的科研机构，其全资企业北京中水科工程集团有限公司自然也属于国有企业。

此外，从公司的性质和所属行业来看，北京中水科工程集团有限公司被明确标记为国有企业，并属于水利工程类行业。这也进一步证实了其国企的身份。

综上所述，可以确认北京中水科工程集团有限公司是一家国有企业。