军校非指挥类专业毕业后，学员通常会被分配到部队定点医疗机构、科研单位或技术性保障部门。

非指挥类专业主要是为部队培养专业技术军官和文职干部。这些专业的学员在学习过程中会深入钻研特定领域的知识，如军事医学、军械技术或军事交通等，毕业后成为该领域的专家。因此，他们往往被分配到需要高度专业技术的部门，如部队医院、科研院所或技术保障单位。

在部队中，这些专业技术军官或文职干部将主要从事教学科研、技术保障等专业技术工作，他们的专业知识和技能将对提升部队的整体技术水平和战斗力发挥重要作用。虽然非指挥类军官的升职速度可能相对较慢，但他们在专业技术领域内的晋升和发展空间仍然是广阔的。

总的来说，军校非指挥类专业毕业后的去向主要是部队的专业技术部门，他们将利用所学专业知识为部队的现代化建设贡献力量。