深信服总部位于广东省深圳市。

深信服科技股份有限公司是一家成立于2000年的知名企业，其总部原位于深圳市南山区学苑大道1001号南山智园A1栋。然而，公司近期根据经营发展需要，已搬迁至新的办公地址。目前，深信服总部的新地址是广东省深圳市南山区西丽街道仙洞路16号深信服科技大厦。

值得注意的是，除了深圳总部外，深信服科技还在其他地区设有分支机构，如北京等地，但这些并不改变其总部的地理位置。因此，对于问题“深信服总部在哪里”，答案是广东省深圳市南山区西丽街道仙洞路16号深信服科技大厦。