百雀羚的总部设在上海。

具体来说，上海百雀羚日用化学有限公司的详细地址是安远路518号宝华城市晶典大厦F11层，这可以被视为百雀羚的一个总部地点。此外，百雀羚在上海还有其他的办公或生产地点，如上海百雀羚有限公司位于上海市浦东新区金海路3288号4幢T388室。这些信息都表明，百雀羚的主要运营和管理中心设在上海。

虽然百雀羚可能在全国范围内设有多个分支机构或销售点，但其总部的核心管理和运营职能主要集中在上海。因此，对于问题“百雀羚总部在哪里”，答案是上海。