海蜇的保存方式因需求而异。新鲜海蜇可以用盐矾法保存，将海蜇按一定比例用盐和矾腌制，这能抑制微生物生长，延长保质期。具体做法是在容器底部铺一层盐矾混合物，放一层海蜇，再铺盐矾，如此重复，顶层多撒些盐矾，腌制一段时间后，海蜇中的水分会渗出，变得紧实，能保存数月。若想短期保存，可将海蜇处理干净后，放入清水中浸泡，每天换水，能保存几天。制成海蜇皮或海蜇头后，保存相对容易。干燥的海蜇皮、海蜇头可放在干燥通风处，能保存较长时间；也可装入密封袋放冰箱冷藏，食用前取出用清水泡发洗净。