日本南海海槽位于地球的西北太平洋地区，具体处于日本列岛西南侧，菲律宾海板块与欧亚大陆板块的交界处。它从日本静冈县骏河湾一直延伸到九州岛以南海域。这一区域地质活动频繁，由于板块间的相互作用，容易引发地震和海啸等自然灾害。