马鬃山服务区位于甘肃省酒泉市肃北蒙古族自治县马鬃山镇。所以，马鬃山服务区归甘肃省酒泉市肃北蒙古族自治县管辖。马鬃山镇地处甘肃、内蒙古、新疆三省区交界处，是肃北县北部的一个边境重镇，而该服务区依托当地地理位置，为过往司乘人员提供服务。