年底营业账簿印花税可以通过电子税务局进行申报。

首先，登录电子税务局，依次点击“我要办税”—“税费申报及缴纳”—“按期应申报”—“财产和行为税合并申报”。然后选择印花税后的“税源采集”，进入印花税税源采集界面。

在印花税税源采集界面，选择“按期申报”，再点击“新增按期申报税源”，填写税源信息。在填写时，税款所属期应选择包含年底的期间，比如如果是申报全年的，则选择1月1日至12月31日。

税源信息填写完毕后，点击“保存”，然后点击“确定”确认保存。接着，点击右上角的“提交税源信息”，确认提交后，跳转到申报界面。

在申报界面，勾选印花税，然后点击“申报”。系统会自动带出合同等信息，检查无误后，点击“申报”即可完成年底营业账簿印花税的申报工作。

请注意，具体的申报流程可能因地区和具体政策有所不同，建议在实际操作前咨询当地税务局或查阅相关操作指南。