上扬斯克位于俄罗斯西伯利亚东北部。它地处北极圈以北，在勒拿河下游河畔。上扬斯克所在的地区气候条件极为恶劣，属于典型的亚寒带针叶林气候，冬季漫长且寒冷，是北半球寒极之一，最低气温曾低至-71.2℃。此地地理位置偏远，交通不便，但在历史上曾作为流放地，如今也是研究北极地区气候、生态等方面的重要地点。