为了保护中药资源可持续利用，不包括的措施是实施中药资源产业优化配置工程。

中药资源可持续利用的措施主要集中在以下几个方面：首先，要加强中药材的规范化种植和养殖，通过推行中药材生产质量管理规范，保护中药资源和确保可持续利用；其次，需要开展中药资源的普查，并建立野生资源的濒危预警机制，以此来保护中药的种质和遗传资源；再者，通过建立中药数据库和种质资源库，可以有效地收集和保存与中药品种、产地、药效等相关的数据；此外，还应加强中药材新品种的培育，并开展对珍稀濒危中药资源的替代品研究，从而确保中药的可持续发展。

在实施这些措施时，国家也出台了一系列的政策和法规，比如推进中药材的产业化经营，并制订了有利于中药现代化发展的价格和税收政策，同时完善了中药的注册审评办法，以加强对中药资源及中药知识产权的保护管理力度。

综上所述，虽然实施中药资源产业优化配置工程在一定程度上可能有助于中药资源的合理利用，但在列举的保护中药资源可持续利用的具体措施中，它并未被明确包含。因此，根据提供的选项，可以判断出不包括的措施是实施中药资源产业优化配置工程。