制药工程专业毕业后，一般可以在药品研发、生产与管理、医药销售与市场等方向工作。

具体来说，你可以选择进入药品研发领域，从事新药开发、药物分析、药物制剂等工作，这要求具备较强的实验技能和创新能力。也可以考虑在制药企业担任生产、质量管理等职位，负责药品的生产工艺、质量控制及GMP规范实施，这更注重实践经验和规范管理。此外，还可以从事医药代表、产品经理等职业，负责药品的市场推广和销售工作，这需要具备良好的沟通能力和市场敏锐度。

随着医药行业的快速发展和人们对健康需求的不断增加，制药工程专业的就业前景非常广阔。新药研发、智能制造等领域的兴起，也为制药工程专业毕业生提供了更多的就业机会和发展空间。

总的来说，制药工程专业毕业后，你可以根据自己的兴趣和职业规划，在多个领域找到适合自己的工作机会。