蓬莱仙洞是喀斯特熔岩地貌，也可以称为岩溶地貌。

这种地貌是由于地下水与地表水对可溶性岩石，如石灰岩，进行长期的溶蚀、侵蚀、沉淀和沉积作用，以及重力崩塌、坍塌、堆积等地质过程而形成的。蓬莱仙洞就是在这种独特的地质作用下，经过千百万年的演变，形成了其多层次、多阶段、多堆积形态的大型溶洞景观。