1.微生物菌肥可以与尿素混合使用，但在施用微生物菌肥前48小时内，应避免使用农药和杀虫剂，以免影响效果。2.施用方法：-拌苗床土：每平方米苗床土使用200～300克微生物菌肥，与苗床土混合后播种。-底肥追肥：每亩使用1～2公斤微生物菌肥，可与农家肥、化肥或细土混合后沟施、穴施或撒施。在水稻基肥、蘖肥、穗肥中，微生物菌肥可替代20%的化肥。-蘸根灌根：每亩使用1～2公斤颗粒型微生物菌肥（碾碎后使用），与水按3～4倍比例混合，用于移栽时蘸根或栽后灌根。-园林盆栽：每公斤盆土使用10～15克微生物菌肥作为追肥或底肥。-冲施：每亩使用1～2公斤微生物菌肥与化肥混合，稀释后随水灌溉冲施。-水稻施用：宜早不宜迟，尽量在分蘖完成前施用。-种肥：每亩使用0.5～1公斤微生物菌肥与种子拌匀，阴干或风干后播种。-底肥拌肥：每亩使用1～2公斤微生物菌肥与有机肥、化肥、复合肥拌匀作基肥。-追肥拌肥：每亩使用0.5～1公斤微生物菌肥与化肥拌匀作追肥。-水稻育秧：可拌种后播入育秧田，或每亩使用2～4公斤微生物菌肥与10～20倍细土混合，作为育秧田底肥。