纸杯飞行器的飞行原理主要依赖于空气动力学中的伯努利效应、旋转产生的离心力以及马格努斯效应。

当纸杯被改造成特定形状并快速旋转时，能够形成气流差异，从而产生向上的升力。具体来说，旋转的纸杯会带动周围的空气旋转，导致纸杯一侧流体速度增加，另一侧流体速度减少，形成压力差，进而产生升力。同时，旋转产生的离心力也有助于纸杯在空中保持悬浮状态。

此外，马格努斯效应也在纸杯飞行器中发挥作用。当纸杯以一定速度旋转并向前移动时，会在纸杯周围形成一个低压区域，吸引周围空气流入，从而产生额外的升力，使纸杯能够在空中飞行更远的距离。

综上所述，纸杯飞行器的飞行原理是通过巧妙的设计和改造，利用空气动力学原理和马格努斯效应，创造出足够的升力来克服纸杯的重力，实现纸杯在空中的飞行。