税务稽查局和跨区域稽查局各有优势，无法简单地说哪个更好。它们在不同的情况下发挥着各自的作用。

税务稽查局是负责查处税收违法违规行为的专门机构，对维护税收秩序和保障国家税收安全具有重要作用。它们主要对纳税人进行事后监督和检查，以防止和打击偷税、逃税等违法行为。税务稽查局的存在有力地维护了税收法律的尊严，保障了国家的财政收入。

跨区域稽查局则是打破行政区划的限制，负责辖区涉税案件的检查和执行。这种机构设置可以更好地应对团伙案件和涉税问题集中的高风险行业，提高案件查办的效率和质量。跨区域稽查局通过项目制管理，组建稽查团队，明确工作时限和工作标准，能够更有效地打击税收违法行为。

总的来说，税务稽查局和跨区域稽查局在税收征管体系中都扮演着重要角色。它们各自具有不同的特点和优势，共同维护着国家的税收秩序和安全。因此，无法简单地判断哪个更好，而是需要根据具体情况和需求来选择合适的机构进行税收监管。