南京必去的5个博物馆包括南京博物院、南京市博物馆、太平天国历史博物馆、六朝博物馆和江宁织造博物馆。

南京博物院：作为中国最早的大型综合性博物馆之一，地位举足轻重。藏品多达四十多万件，历史、特展、数字、艺术、非遗、民国，六大馆区各具特色，仿佛能带你穿越古今。

南京市博物馆：馆址朝天宫，素有“金陵第一胜迹”之美誉，为江南地区现存规模最大、保存最为完整的明清官式古建筑群落。这里的银杏黄了的时候，特别适合拍照。

太平天国历史博物馆：位于瞻园，是南京现存历史最久的一座园林，江南四大名园之一，素有金陵第一园的美誉。园内多处栽植红枫、鸡爪槭、枫香等，是秋日赏景的好去处。

六朝博物馆：这是目前国内展示六朝文物比较全面的遗址博物馆，也是反映六朝文化最系统的专题博物馆。仿佛能让你穿越回那个历史时代。

江宁织造博物馆：这里不仅有红楼梦曲、中国旗袍、云锦精品等展览，还有织署戏台、红楼书场等，是个融合了历史文化与现代展览的新型博物馆。