我国现存医学文献中最早的典籍是《黄帝内经》。

《黄帝内经》是中国传统医学四大经典著作之一，且是第一部冠以中华民族先祖“黄帝”之名的医学巨著。它不仅在中医文献中具有极其重要的地位，而且也是现存成书最早的医学典籍。该书深入探讨了人的生理学、病理学、诊断学、治疗原则以及药物学，为中医理论体系的发展奠定了坚实基础。

值得一提的是，《黄帝内经》在理论上建立了中医学的多个重要学说，如“阴阳五行学说”、“脉象学说”、“藏象学说”、“经络学说”等，其医学理论深深植根于中国古代哲学思想，同时也反映了中国古代朴素唯物主义的辩证思考。

尽管《难经》、《伤寒杂病论》等也是极其重要的医学典籍，但它们在成书时间上均晚于《黄帝内经》，因此，《黄帝内经》无疑是我国现存医学文献中最早的典籍。