科三取消预约不算浪费一次机会。

科目三的预约按照规定，考生可以在网上取消预约，或让驾校工作人员帮忙取消预约，考试名额将不再保留，预约后的3~5天可以收到成功取消预约的短信。只要预约还没成功，就可以直接取消预约，不算考试次数，也不算是浪费一次机会，不影响下次预约考试。

但是，如果已经成功预约了科目三的考试，并且没有取消预约，也没有参加考试，那么这种情况就会被视为缺考，也就是弃考，会判定本次考试不合格，算是浪费了一次考试机会。

所以，只要及时取消预约，就不会算作浪费考试机会，但需要注意的是，每个科目只有5次预约机会，每次预约有两次考试机会。因此，应尽量避免无谓的缺考或弃考，珍惜每一次的考试机会。