违章指挥是指不遵守安全生产规程、制度和安全技术措施交底或擅自更改安全施工方案进行的指挥；违章作业是指不遵守施工现场的安全制度，进入施工现场不戴安全帽、高处作业不系安全带和不正确使用个人防护用品等行为；违反劳动纪律则是指不履行劳动合同及违约应承担的责任，不遵守考勤与休假纪律、生产与工作纪律等行为。

详细来说，违章指挥通常表现为管理者不顾安全规定，强行要求员工进行可能造成危险的工作，比如无视恶劣天气或设备状况不佳等风险因素，强行进行作业。这种行为往往会增加事故发生的概率，严重威胁员工的安全。

违章作业则是指员工在生产过程中，不按照既定的安全操作规程进行作业。比如，在需要佩戴专业防护装备的环境中不佩戴，或者在进行高空作业时不采取必要的安全措施等。这些行为都极易导致工伤事故的发生。

而违反劳动纪律，主要是指员工不遵守公司或组织规定的劳动规则和纪律，包括迟到、早退、旷工等不遵守考勤制度的行为，以及在工作时间做与工作无关的事情，如玩手机、闲聊等违反工作纪律的行为。这些行为虽然可能不会直接导致安全事故，但会严重影响工作效率和团队氛围，长远来看，也可能对安全生产造成间接影响。