南京被称为石头城，是因为它是在石头山的基础上修建起来的。

这个称呼主要起源于三国时期，孙权在清凉山西麓的石头山上修建了一座城池，利用天然峭壁作为城墙，环山筑造，周长大约六里。这座城池以石头为主要建材，因此得名“石头城”。它依山傍水，地势险要，是长江上的重要军事要塞，控制着秦淮河入江河口。

石头城不仅是南京的重要军事屏障，也承载了深厚的历史文化底蕴。随着时间的推移，虽然石头城逐渐失去了军事作用，但它作为南京的别称却流传下来，成为这座城市历史和文化的象征。

如今，南京的石头城遗址已经成为一处重要的历史文化遗产，吸引着无数游客前来参观凭吊，感受这座古老城市的独特魅力。