南海海沟位于菲律宾以东、日本琉球群岛以南的西北太平洋海域。它大致呈南北走向，处于菲律宾板块与欧亚板块的交界处。这个区域地质活动频繁，是板块俯冲带，菲律宾板块在此处向欧亚板块下方俯冲，从而形成了深邃的南海海沟。