秦岭站位于陕西省宝鸡市凤县黄牛铺镇。它地处秦岭山脉脚下，坐落在宝成铁路线上。该站周边地形以山地为主，秦岭的巍峨山脉环绕四周。其具体经纬度大致在北纬33°56′、东经106°22′附近。由于处于秦岭这一重要地理分界线区域，气候兼具南北过渡的特点。站址所在地植被丰富，多为温带和亚热带交汇的植被类型。铁路线从这里穿过，使得秦岭站成为宝成铁路上的一个重要节点，对于沟通南北交通、促进区域经济交流有着重要意义。