子午工程二期是国家重大科技基础设施，它并非位于单一地点，而是由多个台站和观测设施组成，分布在全国多个地方。其沿东经120°子午线附近，北起漠河、经北京、武汉，南至海南儋州；沿北纬30°子午线附近，东起上海、经重庆，西至拉萨，形成一个大型的空间环境观测网络。通过这些分布广泛的站点协同工作，子午工程二期得以对地球空间环境进行全方位、多要素的综合观测，为空间天气研究等提供关键数据支撑。