大连406路公交车运行轨迹贯穿多个区域。它从百合山庄站出发，途经高新园区的多个站点，如大有恬园、中国华录等，方便周边居民出行。接着会经过海事大学、东北财经大学等高校，为师生提供交通便利。随后进入星海广场区域，路过星海浴场等站点，乘客可在此欣赏海景、前往海滨浴场休闲。之后会经过会展中心等站点，该区域有较多商务活动和展览场所。继续前行会到达和平广场，这里商业氛围浓厚。再经过一二九街等站点，最后抵达中山广场站。406路公交车的运行轨迹连接了居民区、高校、商业区、旅游景点等多个重要区域，为市民和游客的出行提供了极大的便利。