1、两者的性质不同

酒曲是酒粬在经过强烈蒸煮的白米中，移入曲霉的分生孢子，然后保温，米粒上便会茂盛地生长出菌丝。

酵有机物由于某些菌或酶而分解称“发酵”。能使有机物发酵的真菌称“酵母菌”。亦称“酵母”、“酿母”。

2、两者的起源不同

酒曲的起源已不可考，关于酒曲的最早文字可能就是周朝著作>中的“若作酒醴，尔惟曲蘖”。

酵母早在公元前3000年，人类开始利用酵母来制作发酵产品。最早在市场上销售的产品是酵母泥，这种产品的特点是发酵速度快，但运输和使用不便，产品的商业化受到了一定的限制。

3、两者的用途不同

酒曲是用来制造酒、甜酒和豆酱等。酒曲上有大量的微生物，还有微生物所分泌的酶，糖在酶的催化作用下分解乙醇。

酵母是食用作用，在美国、日本及欧洲一些国家在普通的粮食制品如面包、蛋糕、饼干和烤饼中掺入5%左右的食用酵母粉以提高食品的营养价值。

参考资料来源：百度百科-酒曲

参考资料来源：百度百科-酵母