不归学校管。交大二附院院长并不归学校管理，交通大学第二附属医院是由交通大学在北京市投资建设的一家三级甲等专科医院，是交通大学的独立法人，由该院董事会负责管理。交通大学第二附属医院位于北京市海淀区中关村南大街甲2号，占地面积约为36万平方米，总建筑面积约为26万平方米。