一、成分不同

1、非碳素墨水：黑色非碳素墨水的成分是直接染料或者酸性染料的磺酸盐。

2、碳素墨水：碳素墨水中的主要成分是谈（C）。

二、特点不同

1、非碳素墨水：对纸张渗透力很强促染良好。

2、碳素墨水：碳在常温常压下化学性质很稳定，不容易与其他物质反应。因此用碳素墨水书写的文字便于保存，不易褪色。

三、优点和缺点不同

1、非碳素墨水： 非碳素墨水不会堵笔，不过颜色不会有碳素墨水这么深，例如颜色可能不够深，也因为流动性比较好，容易洇纸。

2、碳素墨水：碳素墨水书写的字迹坚劳、耐水、永不褪色。碳素防水，颜色上黑亮好看些，但容易堵笔。

参考资料来源：

百度百科-碳素墨水

百度百科-墨水