1、首先第一步我们打开软件之后，在软件界面中先绘制好一个想要编辑修改的原子。2、绘制好原子之后，使用鼠标右键点击想要修改颜色的原子，点击之后在出现的选项中，选择其中的Color这个颜色设置选项。3、并点击这个颜色设置选项之后打开设置选择颜色的界面，点击其中的Select这个选择按钮。4、点击之后用取色器在界面中点击自己想要改变的颜色。5、最后选择好颜色之后，在下方可以看到颜色的预览，满意的话点击右上角的OK按钮保存颜色的修改操作就可以了。