色谱是一种分离分析方法，分离是其核心。因此起到分离作用的色谱柱是色谱系统的核心。色谱仪对色谱柱的要求是选择性好，柱效高且分析速度快。用于分析的各种微粒填料如以以硅胶为基质的键合相及多孔硅胶、氧化铝、多孔碳及有机聚合物微球等粒度一般为3至10μm，柱效的理论值可以达到五至六万每米。