微生物多样性产品在食品发酵过程中起着关键作用。例如，在酿造葡萄酒与啤酒时，不同种类的酵母和细菌协同作用，产生独特的风味和香气。酵母发酵糖分生成酒精，而特定细菌则产生有机酸和酯类，为产品带来复杂口感。在酸奶与奶酪制作中，乳酸菌扮演着重要角色。它们通过发酵乳糖产生乳酸，促使牛奶凝固并形成独特质地与风味。同时，其他微生物的参与可能会引入特殊风味。传统发酵食品如泡菜与豆豉中，微生物群落多样性决定了发酵进程、产物品质与安全性。有益霉菌分解蛋白质与碳水化合物，产生鲜味物质。微生物多样性还丰富了发酵食品营养，一些微生物能合成维生素、氨基酸等，提高食品营养价值。