有。目前有两条地铁线路可以从东莞到深圳，分别是穗莞深城际轨道交通线和清远线。穗莞深城际轨道交通线是连接广州、东莞和深圳的城际铁路，全长116.62公里，设计时速140公里/小时。从中堂到长安之间的10个站均为东莞地区车站，覆盖了东莞多个城镇。从东莞搭乘穗莞深城际轨道交通线，可以直达深圳机场北站和深圳机场站。清远线是连接清远、东莞和深圳的地铁线路，全长83.3公里，设计时速120公里/小时。从东莞搭乘清远线，可以在樟木头站换乘7号线或11号线，进入深圳市区。