员工劳动合同中违约金的设定并不完全违法。通常情况下，若劳动者违反服务期承诺或竞业限制条款，用人单位有权与之约定违约金的赔偿事宜。然而，除了这两项法律规定的特殊情形之外，用人单玉无权任意设定劳动者应承担的违约金。其中，服务期的约定源自于用人单位向劳动者提供专项培训费用并进行专业技术培训的行为；而竞业限制则是针对劳动者离职后在特定时间、区域内从事同行业或存在竞争关系岗位活动的约束。综上所述，判断员工劳动合同违约金是否合法，必须结合详细的合同条款规定及相关法律法规予以全面评估。