将塔吊基础放在地下室底板以下存在的缺点有：1.基础底板破坏：如果塔吊基础设计不当或安装不规范，会导致基础底板的结构完整性受到破坏，进而影响整个地下室的结构安全。2.施工难度增加：将塔吊基础放在地下室底板以下需要在进行地下室施工时进行额外的基础设计、施工和安装，增加了施工难度和时间。3.设备维护困难：塔吊基础位于地下室底板以下，使得设备维护和检修变得更加困难，需要采取相应的措施进行解决。4.空间受限：地下室底板下的空间通常较为有限，无法满足塔吊基础的安装和操作要求。5.承载能力限制：塔吊基础需要承受较大的上部荷载，如果地下室的承载能力不足，会导致塔吊基础无法正常运行。