赔付一个。根据运费险投保理赔原则,每个淘宝订单只能投保一份运费险,相应的每份运费险就只能得到一份理赔,且每个退货快递运单只能得到一份理赔。即有两个订单,每个订单都购买了运费险,当两个订单一起进行退货时,运费险只能赔付一次。