职能不同。1、行政审批局为市政府派出机构，履行对市级（县级）职能部门进驻中心、开展事项集中审批的组织协调、管理监督和指导服务职能。2、市场监督管理局，为地方政府组成部门，负责本市市场综合监督管理。负责组织和指导本市市场监管综合执法工作。