可以。医院进货时应该开具正规的增值税专用发票或者普通发票作为采购凭证。如果对方是开具门诊部发票，那么需要确认该门诊部是否具有发票开具资质和合法性，并且需要核实该门诊部是否能够开具与采购商品相符的正规发票。