非纯种微生物。传统的发酵工程是以非纯种微生物进行的自然发酵，或以纯种微生物进行的工业化发酵都称为传统的发酵工程。酒类饮料生产中常以谷物或水果（葡萄、荔枝等）为原料经不同的微生物（酵母菌、曲霉等）发酵，加工制成不同的酒。儿童们喜欢吃的酸奶也是在鲜奶里加入了乳酸菌经发酵而成。醋和酱等也是我国传统的调味品。