种类不同，形状不同。1、种类不同：肠球菌属于革兰阳性球菌，而大肠杆菌属于肠杆菌科埃希氏菌属细菌。2、形状不同：肠球菌为圆形或椭圆形，呈链状排列，而大肠杆菌为两端钝圆的短杆菌。