针对已建立电子档案管理系统的单位，会计信息系统的实施使得与电子发票相关的记账凭证、报销凭证等已全部实现电子化。在这种情况下，电子发票及其他相关电子会计凭证可以通过归档接口或手工导入电子档案管理系统，进行整理、归档并实现长期保存。为确保保存过程的正确性，可参照《企业电子文件归档和电子档案管理指南》（档办发〔2015〕4号）中提供的方法进行操作。若与电子发票相关的记账凭证、报销凭证等未实现电子化，电子发票可单独通过归档接口或手工导入电子档案管理系统进行整理、归档并长期保存。在整理、归档、长期保存时，同样需遵循《企业电子文件归档电子档案管理指南》（档办发〔2015〕4号）的规定，确保文件的完整性和安全性。对于无电子档案管理系统的单位，若实施了会计信息系统且与电子发票相关的记账凭证、报销凭证等已全部实现电子化，电子发票及关联凭证可被移交至会计档案管理人员保存，并编制档号。在此过程中，会计档案管理人员需确保按照相关指南要求进行操作，以确保文件的合规性和有效性。总之，无论是已建立电子档案管理系统的单位，还是无此类系统但实施了会计信息系统的单位，关键在于确保与电子发票相关的记账凭证、报销凭证等电子会计凭证的整理、归档及长期保存工作。通过遵循相应的管理指南，可确保这些重要文件的安全、完整保存，以备未来查阅及审计需要。详情