会的。1、支付宝上的备用金不及时还款也是会上征信系统的，对个人的信用程度有很大的影响。2、而在贷款买房买车的时候银行会对用户进行综合评估，综合评估的最大参考面就是征信，所以备用金不及时归还会影响综合评估。