不影响。考了瑶医证不会影响考临床执业助理医师，临床执业助理医师是具有高等学校医学专科学历，中等专业学校临床医学专业学历，在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中试用期满一年的，即可报考。临床助理医师是医师资格考试的一种，医师资格考试性质是行业准入考试，是评价申请医师资格者是否具备从事医师工作所必须的专业知识与技能的考试。