两者区别是化学构造、生理功能、稳定性。1、化学结构：反式脂肪酸是由一个脂肪酸和一个碳原子组成的化合物，结构式是C6，分子量是66000，非常不稳定。而不饱和脂肪酸是至少含有一个双键的脂肪或脂肪酸链。2、生理功能：反式脂肪酸对人体的主要作用是会损伤血管壁，会使胆固醇在血管壁上沉淀，容易引起动脉硬化。而不饱和脂肪酸可以使胆固醇酯化，促进胆固醇的代谢，减少胆固醇沉积在血管壁上，预防动脉硬化。3、稳定性：反式脂肪酸比较安全，不容易使人体内胆固醇升高，对心脏有保护作用。而不饱和脂肪酸比较安全，很少引起肥胖。