两者区别有位置不同、历史不同、班次不同。1、位置不同：泉州站位于泉州市丰泽区北峰街道普贤路；泉州东站位于泉州市丰泽区城东街道城华南路。2、历史不同：泉州站建于2010年；泉州东站建于1958年。3、班次不同：泉州站高铁班次有21个，动车班次有196个；泉州东站高铁班次有31个。