数据精度问题，数据格式问题等。gis修改xy容差后图斑发生变形是因为数据精度问题，如果图斑数据的精度与GIS系统的精度不一致，修改XY容差会导致图斑变形，需要在GIS系统中设置适当的数据精度，以确保与图斑数据精度一致。或者是因为数据格式问题，如果图斑数据格式与GIS系统不兼容，修改XY容差会导致数据丢失或图斑变形。需要确保图斑数据格式与GIS系统兼容，或者在数据导入前进行适当的格式转换。