区别在于其数据结构和处理方式的不同。数据库是一种结构化的数据存储方式，它将数据按照一定的格式和规则进行组织和存储，并提供了一组完整的数据操作和管理功能，包括数据查询、插入、修改和删除等操作，以及备份和恢复等管理功能。文件系统则是一种基于文件的数据存储方式，它将数据以文件的形式进行组织和存储，每个文件包含了一组数据，并提供了一组文件操作和管理功能，包括创建、打开、读写和删除等操作，以及文件备份和恢复等管理功能。