上海实质副局长和二级巡视员在级别和职责上有明显的区别。1.从级别上看，实质副局长是局级，这是我国公务员的一个级别，局级及以上通常被视为国家高级干部。而二级巡视员属于非领导职位，只设在地、厅、司、局级以上国家行政机关，巡视员应担任副局级领导职务或副巡视员五年以上，副巡视员应担任县处级专职领导职务或调研员五年以上。2.从职责上看，副局长和巡视员在各自的领域中具有不同的职责。副局长是行政机关的领导职位，负责管理和领导日常工作，而巡视员的主要职责是监督和检查下级机关的工作情况，对政策执行情况进行评估和反馈。总的来说，上海实质副局长和二级巡视员在级别和职责上都有显著的区别，各自在行政体制内扮演着不同的角色。