此举或涉嫌违法。依照我国现行劳动法律法规，员工加班理当享有对应薪资待遇，且迟到与加班并非对等概念，无法相互抵消。迟到通常构成公司内部考勤违规，需接受相关纪律处分。然而，加班则属于员工在休息日或工作日延长工作时间之行为，雇主有责任按规支付加班费用。若企业仅以迟到为由扣减工资，员工可搜集加班证据，如加班申请单、工作成果、证人证词等，与企业进行协商。若协商无果，可向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以保障自身合法权益。