是的，甘肃公航旅和甘肃高管局合并了。

详细解释如下：

甘肃公航旅和甘肃高管局经过一系列整合措施，最终实现了合并。这一举措是为了更好地整合甘肃省的交通运输资源，提高管理效率和服务水平。甘肃公航旅主要负责公路、航空、旅游等领域的投资和运营，而甘肃高管局则负责高速公路的管理和运营。两者的合并可以更好地协调交通运输资源，推动甘肃省交通运输事业的发展。

这一合并举措的实施，旨在优化甘肃省的交通产业布局，促进交通与旅游、航空等产业的深度融合。合并后，新的机构将承担起甘肃省内交通基础设施建设、运营和管理的重要任务，为甘肃省的经济社会发展提供更加便捷、高效的交通服务。

甘肃公航旅和甘肃高管局的合并，标志着甘肃省在交通运输领域的改革取得了重要进展。这一改革将有助于提升甘肃省的交通综合实力，为甘肃省的经济社会发展提供更加有力的支撑。合并后的新机构将继续致力于提高服务质量，推动甘肃省交通运输事业的持续健康发展。