在sun公司的官方网站上，你可以找到适用于Linux操作系统的JDK版本。通常，这些文件的名称格式类似于jre-1_5_0-linux-i586.bin。你可以将这个文件放置在你想要安装的目录中，比如/usr/java/。为了确保你能够执行这个文件，你需要先修改文件的权限，使用命令chmoda+xjre-1_5_0-linux-i586.bin来实现。执行安装过程是通过命令./jre-1_5_0-linux-i586.bin来完成的。安装完成后，你需要编辑所在用户的bash配置文件，这通常位于~/.bash_profile。你可以使用vi编辑器来打开这个文件，并添加JAVA_HOME=/usr/java/。接着使用export命令来导出JAVA_HOME环境变量。这样做的目的是为了让系统能够找到Java环境。以前，我对NetBeans有一些了解，但是没有接触过Eclipse。对于Tomcat来说，如果你已经设置了JAVA_HOME环境变量，那么你只需要解压Tomcat文件就可以开始使用了。MySQL方面，我没有经验，但我在Linux系统中安装过Oracle和DB2，不知道其他数据库管理工具的情况如何。如果你有任何问题，或者需要进一步的帮助，请随时给我发消息。我会尽力提供支持。